PCR-kit til påvisning af “naturlige” GMO’er

For at skabe GMO’er i laboratoriet (indsættelse af eksogene DNA-sekvenser i et målgenom) bruger forskere genvektorteknikken, som er afhængig af visse bakteriers evne, såsom Agrobacterium, til at overføre genetisk materiale. Denne proces replikerer in vitro et fænomen, der ofte forekommer i naturen. I 2019 demonstrerede forskere ved IBMP eksistensen af adskillige naturligt transgene planter, og at dette fænomen havde været hyppigere under planteudviklingen.

Denne laboratorieøvelse foreslår at detektere ved hjælp af PCR i jordnøddegenomet en DNA-sekvens, der er arvet naturligt fra Agrobacterium. Denne tilstedeværelse indikerer en tidligere horisontal genoverførsel under evolutionen.
Eksperimentet udføres i tre faser: ekstraktion/oprensning af prøven (kommercielle rå jordnødder), PCR-amplifikation og agarosegelelektroforese.

Mål: at identificere tilstedeværelsen eller fraværet af et Agrobacterium-gen, suppleret med sekvensanalyse ved hjælp af genetisk software.

Referenceartikler:
Matveeva, TV, Otten, L. Udbredt forekomst af naturlig genetisk transformation af planter af Agrobacterium. Plant Mol Biol 101, 415–437 (2019). https://doi.org/10.1007/s11103-019-00913-y
Edern Appéré, At producere GMO’er er blot at efterligne naturen. Universitetet i Strasbourg (2020)

Varighed af laboratorieøvelsen: 2 sessioner à 60 minutter
Format til 20 studerende
Opbevaring: 12 måneder ved -20 °C